RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RPB11YOL005C BSC1Q12140 328 aa2.57□□□□□ -2
RPB11YOL005C CSR2Q12734 1121 aa2.57□□□□□ -2
RPB11YOL005C SGS1P35187 1447 aa2.57□□□□□ -2
RPB11YOL005C YFL068WP0CX99 160 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YLL066W-AP0CY00 160 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YLL067W-AP0CY01 160 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C HNM1P19807 563 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C GID7P25569 745 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C GAC1P28006 793 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C RAD24P32641 659 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YBR144CP34215 104 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YKL100CP34248 587 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C DOT5P40553 215 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C AXL1P40851 1208 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C FAR3P46671 204 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C NUP100Q02629 959 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YMR160WQ03823 816 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C YLR352WQ06479 807 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SSK1Q07084 712 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C APL5Q08951 932 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C RCN2Q12044 265 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C TIP41Q12199 356 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SPE4Q12455 300 aa2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RPB11YOL005C SEM1O94742 89 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C PUT2P07275 575 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C BOS1P25385 244 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C SYN8P31377 255 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C SEF1P34228 1148 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C PHD1P36093 366 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C RKM3P38222 552 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C BZZ1P38822 633 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C ALG5P40350 334 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C RMD8P43620 662 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C EFM6P53970 246 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C YPL014WQ02606 381 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C YKU80Q04437 629 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C TDA9Q04545 1251 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C YLR281CQ05863 155 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C YDL057WQ07379 328 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C FMP45Q07651 309 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C TAH18Q12181 623 aa2.55□□□□□ -2
RPB11YOL005C BAR1P12630 587 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C MRP13P12686 339 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C CBS1P14066 229 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C SGF29P25554 259 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C GCS1P35197 352 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C MIC60P36112 540 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C NUP133P36161 1157 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C EFM2P38347 419 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C ARP1P38696 384 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C PHO90P39535 881 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C FLC2P39719 783 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C FET5P43561 622 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C SNG1P46950 547 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C MRX6P48564 524 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C VID30P53076 958 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C YGL082WP53155 381 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C YGR126WP53274 230 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C RSF1Q05043 376 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C GRS2Q06817 618 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C YEH1Q07804 573 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C CDC45Q08032 650 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C NRT1Q08485 598 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C CTI6Q08923 506 aa2.54□□□□□ -2
RPB11YOL005C PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C GLN3P18494 730 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C SNC1P31109 117 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C SRO77P38163 1010 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C LAG1P38703 411 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C YND1P40009 630 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C RGI2P40188 164 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C YJL068CP40363 299 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.53□□□□□ -2not detected
RPB11YOL005C ATG27P46989 271 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C SHR3Q02774 210 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C MSS11Q03825 758 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C DIC1Q06143 298 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C RTT109Q07794 436 aa2.53□□□□□ -2
RPB11YOL005C NMD4Q12129 218 aa2.53□□□□□ -2
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