RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	MRPL4	P36517	319 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	SMC3	P47037	1230 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	RTT109	Q07794	436 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	CDC45	Q08032	650 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	THI20	Q08224	551 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	ARP6	Q12509	438 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
YKL063C	YKL063C	TSC10	P38342	320 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	ELO1	P39540	310 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	YPI1	P43587	155 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	VPS4	P52917	437 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	BUD32	P53323	261 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	TEN1	Q07921	160 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YKL063C	YKL063C	PUT2	P07275	575 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	LDB16	P25587	256 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SNC1	P31109	117 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SPC110	P32380	944 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MRP20	P32387	263 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	VPS17	P32913	551 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	CNS1	P33313	385 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DBP8	P38719	431 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RIC1	P40395	1056 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	INN1	P53901	409 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	UBX4	P54730	416 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	ARG81	P05085	880 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SPE2	P21182	396 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	FAA2	P39518	744 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DUG3	P53871	357 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	YMR160W	Q03823	816 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	VID22	Q05934	901 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SKG3	Q06315	1026 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	NUS1	Q12063	375 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	LAG1	P38703	411 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	UME6	P39001	836 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	UIP3	P39547	235 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SLZ1	P40167	298 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SHE10	P53075	577 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MUB1	Q03162	620 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SNO4	Q04902	237 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	HSP32	Q08992	237 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	APE1	P14904	514 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SYN8	P31377	255 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	AXL2	P38928	823 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SGM1	P47166	707 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	YGL082W	P53155	381 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	NPR2	P39923	615 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DIA3	P52290	468 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RHO4	Q00246	291 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	GTR1	Q00582	310 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	INA17	Q02888	182 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	GLO2	Q05584	274 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	ENT4	Q07872	247 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	FRE1	P32791	686 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	XRS2	P33301	854 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	YTA12	P40341	825 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	IDP2	P41939	412 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	PSR1	Q07800	427 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RER1	P25560	188 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	PMU1	P36069	295 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
YKL063C	YKL063C	YJL132W	P47014	750 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	MSC1	Q03104	513 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	YKL063C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	TUL1	P36096	758 aa		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	YER010C	P40011	234 aa		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	DSD1	P53095	428 aa		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	RCO1	Q04779	684 aa		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	YDL057W	Q07379	328 aa		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	YKL063C	SYO1	Q07395	620 aa		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.4 ms