RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637955.1

ATP6AP2-231, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 5

Gene ATP6AP2, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATP6AP2-231	ENST00000637955	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PEAK1	Q9H792	1746 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATP6AP2-231	ENST00000637955	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MSTN	O14793	375 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RAB6A	P20340	208 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	USP11	P51784	963 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HDX	Q7Z353	690 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BCL9	O00512	1426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NTF4	P34130	210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PAK2	Q13177	524 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LGR6	Q9HBX8	967 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PLSCR1	O15162	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NFIC	P08651	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BPNT1	O95861	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HMOX1	P09601	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ISL2	Q96A47	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KDR	P35968	1356 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LRRC37A3	O60309	1634 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NCAPD2	Q15021	1401 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MPP2	Q14168	576 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PIDD1	Q9HB75	910 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MEGF6	O75095	1541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PHKG2	P15735	406 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HMX2	A2RU54	273 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GRK4	P32298	578 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NKD1	Q969G9	470 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FBRS	Q9HAH7	460 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FANCG	O15287	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CYP27B1	O15528	508 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PRKAR2B	P31323	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FURIN	P09958	794 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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