RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627074.2

PCBP1-AS1-308, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 871 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 FGRP09769 529 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MAPK4P31152 587 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 GJA8P48165 433 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TFAP4Q01664 338 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CCL14Q16627 93 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TICAM2Q86XR7 235 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 REPS2Q8NFH8 660 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MKL1Q969V6 931 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RNF208Q9H0X6 261 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SH2D4AQ9H788 454 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ZMYM6O95789 1325 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 F5H6K3 240 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 LILRB3O75022 631 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NDUFB10O96000 172 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 IGHA2P01877 340 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 HMGCRP04035 888 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 GJB1P08034 283 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NDUFV2P19404 249 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NOVP48745 357 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 UBXN2AP68543 259 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PDE4BQ07343 736 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 KLRC3Q07444 240 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TTC22Q5TAA0 569 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PACS2Q86VP3 889 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MYH6P13533 1939 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SGPL1O95470 568 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TSPY3P0CV98 308 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TSPY8P0CW00 308 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ERCC3P19447 782 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 HAND2P61296 217 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 GRB14Q14449 540 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SKAP1Q86WV1 359 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 DEFB118Q96PH6 123 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 VWA5AO00534 786 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ORC4O43929 436 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 COBLO75128 1261 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TTLL1O95922 423 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 HOXC6P09630 235 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RGS2P41220 211 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CCNA1P78396 465 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 QPCTQ16769 361 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 WDR78Q5VTH9 848 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 MB21D1Q8N884 522 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 APBA2Q99767 749 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RIPK3Q9Y572 518 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 NEDD4P46934 1319 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RPTORQ8N122 1335 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TSPY2A6NKD2 308 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 POTEB2H3BUK9 544 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 ADORA2AP29274 412 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 PLS1Q14651 629 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 SLFN13Q68D06 897 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-308ENST00000627074 TRPV1Q8NER1 839 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms