RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 AMPD2Q01433 879 aa15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 UBXN1Q04323 297 aa15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 TTI2Q6NXR4 508 aa15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 RHOBTB3O94955 611 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG1Q07617 926 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 KCNB1Q14721 858 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 MB21D1Q8N884 522 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS16A8MUM7 142 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 ATP8B1O43520 1251 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 TSPY3P0CV98 308 aa15.02■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 TSPY8P0CW00 308 aa15.02■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 KLK7P49862 253 aa15.02■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC7Q99615 494 aa15.02■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.02■□□□□ -0
C9orf170-201ENST00000623052 H7C1D1 291 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2C19P33261 490 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 HERVK_113P62684 666 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 H3BQF6 201 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PLCG1P19174 1290 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PPP4CP60510 307 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM14Q14142 442 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TXNRD1Q16881 649 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.02□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CTAGE9A4FU28 777 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RAB21Q9UL25 225 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MAP2K7O14733 419 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZPR1O75312 459 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFA10O95299 355 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 FAM182BQ5T319 152 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 THAP9Q9H5L6 903 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 STX8Q9UNK0 236 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 EDIL3O43854 480 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PRPHP41219 470 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ST5P78524 1137 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GRAPQ13588 217 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 WDR66Q8TBY9 1149 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQC6 194 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC151A5D8V7 595 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ERICH4A6NGS2 130 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 B4DLN1 442 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 KLRF2D3W0D1 207 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC148Q8NFR7 591 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SUGCTQ9HAC7 445 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 FCER1AP12319 257 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 STK4Q13043 487 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L2Q6R6M4 530 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SPZ1Q9BXG8 430 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM9Q9C026 710 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LTBP1Q14766 1721 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RCCD1A6NED2 376 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GNAQP50148 359 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MIIPQ5JXC2 388 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CEP112Q8N8E3 955 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 HPS3Q969F9 1004 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM47Q96LD4 638 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 UBA7P41226 1012 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 BTDP43251 543 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CDK8P49336 464 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GPSM2P81274 684 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GALNT17Q6IS24 598 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms