RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ERBB3P21860 1342 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TIGD1Q96MW7 591 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 MIS12Q9H081 205 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 MTX1Q13505 466 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GBP6Q6ZN66 633 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KCNJ18B7U540 433 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP6O43182 974 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KCNJ12Q14500 433 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RBSNQ9H1K0 784 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KCTD1Q719H9 257 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP10Q86W26 655 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 EBAG9O00559 213 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R5CQ13362 524 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 MORC3Q14149 939 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R5AQ15172 486 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CLCN1P35523 988 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CYP4A11Q02928 519 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 AKT3Q9Y243 479 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RAB20Q9NX57 234 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PDE6CP51160 858 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A2P55011 1212 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 RETREG2Q8NC44 543 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 APOL6Q9BWW8 343 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL6Q8N841 843 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 AMFRQ9UKV5 643 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 GRAPQ13588 217 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PALD1Q9ULE6 856 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L3A6NCW0 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L4A6NCW7 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 BTBD18B2RXH4 712 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PALLDQ8WX93 1383 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN2AP68543 259 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CROCCP2Q86T23 111 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PIGBQ92521 554 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PSMB7Q99436 277 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 BMP3P12645 472 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ABCB4P21439 1286 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CCND2P30279 289 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MNAT1P51948 309 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms