RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 BCL11AQ9H165 835 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 RAB11FIP3O75154 756 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 RASA1P20936 1047 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ADGRE1Q14246 886 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 RAB30Q15771 203 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 IL23AQ9NPF7 189 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 FBXO40Q9UH90 709 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 MSRAQ9UJ68 235 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CD4P01730 458 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 SLC4A3P48751 1232 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 NKX3-2P78367 333 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 SBK1Q52WX2 424 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ARMCX2Q7L311 632 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CHST13Q8NET6 341 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 HERVK_113Q902F9 699 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 TRANK1O15050 2925 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CTAGE5O15320 804 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CYP2C18P33260 490 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 KATNBL1Q9H079 304 aa20.22■□□□□ 0.83
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FCHO1-230ENST00000600058 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.22■□□□□ 0.83
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FCHO1-230ENST00000600058 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 KIFC2Q96AC6 838 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 FEM1BQ9UK73 627 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 FGBP02675 491 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 CABYRO75952 493 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 IGFBP4P22692 258 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 BEX3Q00994 111 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 MKL1Q969V6 931 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 HIPK3Q9H422 1215 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 REV3LO60673 3130 aa20.18■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 IL27Q8NEV9 243 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 ASTN1O14525 1302 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 CEP95Q96GE4 821 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 TLK2Q86UE8 772 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.16■□□□□ 0.82
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FCHO1-230ENST00000600058 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 ASB14A6NK59 587 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 TTLL1O95922 423 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 BMP3P12645 472 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 GRIN2DO15399 1336 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-230ENST00000600058 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-230ENST00000600058 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-230ENST00000600058 PRDM1O75626 825 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-230ENST00000600058 CCL23P55773 120 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-230ENST00000600058 SLFN13Q68D06 897 aa20.14■□□□□ 0.81
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