RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591545.5

SMARCA4-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCA4, Length 5,193 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4-216ENST00000591545 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GCNT3O95395 438 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GAS8O95995 478 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 KRT19P08727 400 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PRR16Q569H4 304 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 POSTNQ15063 836 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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SMARCA4-216ENST00000591545 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 KRT9P35527 623 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 MAGEA1P43355 309 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 NEDD9Q14511 834 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 VPS72Q15906 364 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RNF181Q9P0P0 153 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GMNNO75496 209 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 XKR9Q5GH70 373 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CEP152O94986 1710 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 A0A0D9SFI3 127 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 NAA25Q14CX7 972 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 DYMQ7RTS9 669 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 COL15A1P39059 1388 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 MED23Q9ULK4 1368 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CRB1P82279 1406 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SCG2P13521 617 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 UIMC1Q96RL1 719 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PARP2Q9UGN5 583 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 VCX3BQ9H321 246 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 LAMC1P11047 1609 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 POLA2Q14181 598 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CD19P15391 556 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PPP2R5EQ16537 467 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 NEK8Q86SG6 692 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PODNQ7Z5L7 613 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GDF11O95390 407 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GLI2P10070 1586 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GNA14O95837 355 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 BMP3P12645 472 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CABS1Q96KC9 395 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ADGRB3O60242 1522 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TNNI1P19237 187 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RPS6KA1Q15418 735 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 LGSNQ5TDP6 509 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ADALQ6DHV7 355 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CDHR1Q96JP9 859 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 DAPK3O43293 454 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PCK1P35558 622 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RAB17Q9H0T7 212 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PALD1Q9ULE6 856 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ABI1Q8IZP0 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 VPS52Q8N1B4 723 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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