RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 GMCL1Q96IK5 515 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 LCTP09848 1927 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ADCY6O43306 1168 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 KCNA10Q16322 511 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ARMCX2Q7L311 632 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 RAG1P15918 1043 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 SLC1A4P43007 532 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 FAAP100Q0VG06 881 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 FAM160B2Q86V87 743 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 TOX2Q96NM4 488 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ACAD9Q9H845 621 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 TSPY2A6NKD2 308 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 EPHB4P54760 987 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 KATNBL1Q9H079 304 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 STX8Q9UNK0 236 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF536O15090 1300 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF4-216ENST00000586813 ELP1O95163 1332 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 MCCP23508 829 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CNTN2Q02246 1040 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 FPGSQ05932 587 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 SPC25Q9HBM1 224 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RNF146Q9NTX7 359 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 NMT2O60551 498 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 PLA2G6O60733 806 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ASGR1P07306 291 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 GJA9P57773 515 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 VPS53Q5VIR6 699 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 INCENPQ9NQS7 918 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 TKFCQ3LXA3 575 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 KCTD1Q719H9 257 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 TBX21Q9UL17 535 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 GNASQ5JWF2 1037 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 EVI5LQ96CN4 794 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CTAGE5O15320 804 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ALAS1P13196 640 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CDK7P50613 346 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC174Q6PII3 467 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 32.1
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TRAF4-216ENST00000586813 ASTN1O14525 1302 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 ORC4O43929 436 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 TIMP1P01033 207 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 NOVP48745 357 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 SNAP25P60880 206 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 NKX3-2P78367 333 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-216ENST00000586813 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 ASB14A6NK59 587 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 PDE1AP54750 535 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 TNFAIP2Q03169 654 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 CRBNQ96SW2 442 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 MTMR7Q9Y216 660 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 ARVCFO00192 962 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 FGRP09769 529 aa22.88■■□□□ 1.25
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