RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-204	ENST00000578208	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ALAS1	P13196	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SNAP25	P60880	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ICAM1	P05362	532 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	WTAP	Q15007	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PFAS	O15067	1338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF536	O15090	1300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	SLC27A2	O14975	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CYBA	P13498	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CENPF	P49454	3210 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	SEPT4	O43236	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	SEC23A	Q15436	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	IGHA2	P01877	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MCM5	P33992	734 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	DPF3	Q92784	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PRC1	O43663	620 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	LHX8	Q68G74	356 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ASB14	A6NK59	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	RARB	P10826	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	AKR1A1	P14550	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	KRT32	Q14532	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	USH1G	Q495M9	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ABCB11	O95342	1321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	DDAH1	O94760	285 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	REC8	O95072	547 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	ANTXR2	P58335	489 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-204	ENST00000578208	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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