RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559934.5

PSMA4-215, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSMA4, Length 2,741 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-215ENST00000559934 YY1AP1Q9H869 796 aa24.45■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.45■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 NLRP5P59047 1200 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 GNGT1P63211 74 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CREG2Q8IUH2 290 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EBAG9O00559 213 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ZNF263O14978 683 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ERLIN2O94905 339 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.52e-9■■■□□ 18.9
PSMA4-215ENST00000559934 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.44■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ANO9A1A5B4 782 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SRGNP10124 158 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 DEF6Q9H4E7 631 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PSMB7Q99436 277 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SAMM50Q9Y512 469 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MYH10P35580 1976 aa24.43■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 DNM2P50570 870 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 THAP9Q9H5L6 903 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EXOC1Q9NV70 894 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EHD2Q9NZN4 543 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 EVX2Q03828 476 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SNX12Q9UMY4 172 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.42■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 KLRC4O43908 158 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 NMT2O60551 498 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TTI2Q6NXR4 508 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ARL8AQ96BM9 186 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 KIF5AQ12840 1032 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 FBXW10Q5XX13 1052 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 DISC1Q9NRI5 854 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CXCR5P32302 372 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CCDC96Q2M329 555 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 FAM107BQ9H098 131 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ABCF2Q9UG63 623 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.41■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 STARD3NLO95772 234 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 VAV2P52735 878 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 IQCEQ6IPM2 695 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ATF3P18847 181 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ZBED6P86452 979 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 TTMPQ5BVD1 217 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SH3GL2Q99962 352 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 POLD4Q9HCU8 107 aa24.4■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 PSMA7O14818 248 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 SCG2P13521 617 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 IL2RBP14784 551 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 LRRC15Q8TF66 581 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 LRP5O75197 1615 aa24.39■■□□□ 1.5
PSMA4-215ENST00000559934 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 MOCS3O95396 460 aa24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 PIGBQ92521 554 aa24.39■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 SHTN1A0MZ66 631 aa24.38■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 TRAPPC10P48553 1259 aa24.38■■□□□ 1.49
PSMA4-215ENST00000559934 IQCA1Q86XH1 822 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms