RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ARMCX2Q7L311 632 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 SMIM22K7EJ46 135 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CABYRO75952 493 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 F5H6K3 240 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ATP2A1O14983 1001 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ADCY6O43306 1168 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CD4P01730 458 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 KLRC3Q07444 240 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CHST13Q8NET6 341 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 KIFC2Q96AC6 838 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ZBBXA8MT70 800 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ZEB2O60315 1214 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 NDUFB10O96000 172 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 BEX3Q00994 111 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 TNFAIP2Q03169 654 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CTR9Q6PD62 1173 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 MYH7P12883 1935 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 RABGGTBP53611 331 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CCL23P55773 120 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 ITGA7Q13683 1181 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 NYAP2Q9P242 653 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN3-204ENST00000558394 MYH4Q9Y623 1939 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 RLBP1P12271 317 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 UBE3CQ15386 1083 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 FEM1BQ9UK73 627 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.32■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 BMP1P13497 986 aa21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 OAZ1P54368 228 aa21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 TLK2Q86UE8 772 aa21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.31■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.31■■□□□ 1
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TSPAN3-204ENST00000558394 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 HMMRO75330 724 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 NKX3-2P78367 333 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 TFF2Q03403 129 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 FGD4Q96M96 766 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.3■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ASB14A6NK59 587 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 CTAGE5O15320 804 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ATP5JP18859 108 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 RASA1P20936 1047 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ACAD9Q9H845 621 aa21.29■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.29■■□□□ 1
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TSPAN3-204ENST00000558394 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 FDX1P10109 184 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 MYOGP15173 224 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNQ1P51787 676 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 HAUS7Q99871 368 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 KATNBL1Q9H079 304 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 COG6Q9Y2V7 657 aa21.28■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 ERC2O15083 957 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 B4GALT4O60513 344 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 RAB11FIP3O75154 756 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 PFKMP08237 780 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 CNTN2Q02246 1040 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 SBK1Q52WX2 424 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
TSPAN3-204ENST00000558394 CCER2I3L3R5 266 aa21.26■□□□□ 0.99
TSPAN3-204ENST00000558394 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TSPAN3-204ENST00000558394 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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