RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	KDM4A	O75164	1064 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	PGK2	P07205	417 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	PDHB	P11177	359 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	KRT32	Q14532	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACTN1-215	ENST00000555616		B4E1Z4	1266 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC27A2	O14975	620 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SEPT4	O43236	478 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	COL6A1	P12109	1028 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	KRT23	Q9C075	422 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616		H0YGN5	161 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ICAM1	P05362	532 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNB2	Q92953	911 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	FGD4	Q96M96	766 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RNF146	Q9NTX7	359 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PFAS	O15067	1338 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TNKS	O95271	1327 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	DNM1L	O00429	736 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CYP21A2	P08686	494 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PSMA5	P28066	241 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CNGA1	P29973	690 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC16A2	P36021	539 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	DPF3	Q92784	378 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	EVI5	O60447	810 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SNAP25	P60880	206 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TRDN	Q13061	729 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RABEP1	Q15276	862 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ALAS1	P13196	640 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	AKR1A1	P14550	325 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SEC23A	Q15436	765 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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