RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554360.5

PSMA3-AS1-204, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 2,475 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SMAPO00193 183 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SNHG28P0DPA3 235 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PDHBP11177 359 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 XBP1P17861 261 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ICE2Q659A1 982 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SULF1Q8IWU6 871 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SH2D4AQ9H788 454 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 USP17L5A8MUK1 530 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KLRF2D3W0D1 207 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 DCAF4Q8WV16 495 aa11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TPM2P07951 284 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 JAG1P78504 1218 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MCM4P33991 863 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 USP48Q86UV5 1035 aa11.08□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GUCY1B3Q02153 619 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZNF543Q08ER8 600 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SLFN13Q68D06 897 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRT40Q6A162 431 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MCTP1Q6DN14 999 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FERMT3Q86UX7 667 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GOPCQ9HD26 462 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RESTQ13127 1097 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.641e-8■■□□□ 11.6
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GMCL1Q96IK5 515 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 AIFM3Q96NN9 605 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TMX2Q9Y320 296 aa11.07□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 F5H6K3 240 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SCG2P13521 617 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SLC1A4P43007 532 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KLRC3Q07444 240 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PKN1Q16512 942 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PEX19P40855 299 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CD151P48509 253 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 BRAPQ7Z569 592 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 WRNIP1Q96S55 665 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NDUFB10O96000 172 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MMP1P03956 469 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NF2P35240 595 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PICK1Q9NRD5 415 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 OTOFQ9HC10 1997 aa11.05□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 A0A1W2PRG0 241 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ADM5C9JUS6 153 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CYTH3O43739 400 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRT85P78386 507 aa11.04□□□□□ -0.64
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms