RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550672.5

SLC8B1-211, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC8B1, Length 2,925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-211ENST00000550672 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ZBTB43O43298 467 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 NDUFA10O95299 355 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 KIAA1328Q86T90 577 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC51AQ86UW1 340 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ARL8AQ96BM9 186 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 A0A087X0B3 334 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 PBX1P40424 430 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 DPYDQ12882 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.63□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 BCORQ6W2J9 1755 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ZPR1O75312 459 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 PTPREP23469 700 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 UBXN1Q04323 297 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 POTEDQ86YR6 584 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CABS1Q96KC9 395 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RUFY1Q96T51 708 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 GRIN2DO15399 1336 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RPS6KA4O75676 772 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CYP7A1P22680 504 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MCM3P25205 808 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 NARFQ9UHQ1 456 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 OXER1Q8TDS5 423 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 DOCK2Q92608 1830 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 FAM205CA6NFA0 338 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 BTAF1O14981 1849 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 IDEP14735 1019 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CEP57Q86XR8 500 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CASZ1Q86V15 1759 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 KRT14P02533 472 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CXCR5P32302 372 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CYP27A1Q02318 531 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CUL4BQ13620 913 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 JAG2Q9Y219 1238 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MYH8P13535 1937 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 SGSM3Q96HU1 749 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC51Q96ER9 411 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 PAGE5Q96GU1 130 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 EHD2Q9NZN4 543 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RCCD1A6NED2 376 aa14.59□□□□□ -0.07
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