RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.62■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC174Q6PII3 467 aa23.62■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.62■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ACAD9Q9H845 621 aa23.62■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.62■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 E7EWF7 191 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 MSCO60682 206 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CNGA1P29973 690 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ERICH2A1L162 156 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CDC45O75419 566 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ICAM1P05362 532 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ALAS1P13196 640 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CYBAP13498 195 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 RNF146Q9NTX7 359 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 PNMA2Q9UL42 364 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.6■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 SNAP25P60880 206 aa23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 TINF2Q9BSI4 451 aa23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.59■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 LHX8Q68G74 356 aa23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-212ENST00000549279 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 SEC23AQ15436 765 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 TRPV1Q8NER1 839 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PFASO15067 1338 aa23.57■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.56■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 SEPT4O43236 478 aa23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 RNF20Q5VTR2 975 aa23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.55■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 POTEB2H3BUK9 544 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 SLC27A2O14975 620 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 WTAPQ15007 396 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 NECTIN1Q15223 517 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 DPF3Q92784 378 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.54■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.53■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.53■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.52■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 NSMFQ6X4W1 530 aa23.52■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 CHST3Q7LGC8 479 aa23.52■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 MTA3Q9BTC8 594 aa23.52■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TPCN1-212ENST00000549279 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 MCM5P33992 734 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ANTXR2P58335 489 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 CPVLQ9H3G5 476 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.51■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 CNTN2Q02246 1040 aa23.5■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.5■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.5■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ASB14A6NK59 587 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 KLRF2D3W0D1 207 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 PRC1O43663 620 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 RARBP10826 455 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 AKR1A1P14550 325 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ANO1Q5XXA6 986 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ARMCX2Q7L311 632 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM87BQ96K49 555 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 FGD4Q96M96 766 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-212ENST00000549279 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms