RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 YDJCA8MPS7 323 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SMTNL1A8MU46 457 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MYO1CO00159 1063 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CUTAO60888 179 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 DPEP1P16444 411 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KCNA3P22001 575 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NFIAQ12857 509 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 IDI2Q9BXS1 227 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 EHD4Q9H223 541 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SUFUQ9UMX1 484 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 AKR1B1P15121 316 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PFKFB1P16118 471 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CALML3P27482 149 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SHMT1P34896 483 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 NLRP5P59047 1200 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 NPY5RQ15761 445 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TEX35Q5T0J7 233 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 RESP18Q5W5W9 173 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 IQUBQ8NA54 791 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TNFRSF25Q93038 417 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CEP89Q96ST8 783 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CABP5Q9NP86 173 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ERICH4A6NGS2 130 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 KLRF2D3W0D1 207 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CYTH3O43739 400 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ZNF202O95125 648 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CAVIN2O95810 425 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SOGA3Q5TF21 947 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SHC4Q6S5L8 630 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SDF4Q9BRK5 362 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 VPS33BQ9H267 617 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 MTMR7Q9Y216 660 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 HPSEQ9Y251 543 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SIPA1L1O43166 1804 aa8.82□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FAM205CA6NFA0 338 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TRIM75PA6NK02 468 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TTLL1O95922 423 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 BMP15O95972 392 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PDHBP11177 359 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PTPREP23469 700 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SMARCA1P28370 1054 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SYKP43405 635 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CACNB3P54284 484 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TGFB2P61812 414 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 STX1AQ16623 288 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CFAP100Q494V2 611 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.81□□□□□ -12e-7■□□□□ 10.9
CS-204ENST00000546621 CLIC6Q96NY7 704 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 USP17L5A8MUK1 530 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 STXBP3O00186 592 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 ZBTB7AO95365 584 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 NEFHP12036 1026 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TRAPPC10P48553 1259 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 TCP10Q12799 353 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 GPS2Q13227 327 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 MCTP2Q6DN12 878 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 GALNT17Q6IS24 598 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 SRLQ86TD4 932 aa8.8□□□□□ -1
CS-204ENST00000546621 BLIDQ8IZY5 108 aa8.8□□□□□ -1
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