RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-222ENST00000533362 IL17RAQ96F46 866 aa26.13■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 FCER1AP12319 257 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 CPA1P15085 419 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PTPREP23469 700 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 RGS2P41220 211 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 FLT3LGP49771 235 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 CCDC174Q6PII3 467 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 APOA5Q6Q788 366 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.12■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 ZBTB43O43298 467 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 TRAF1Q13077 416 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 GRB14Q14449 540 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 KCTD2Q14681 263 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PPP2R5BQ15173 497 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 MICU3Q86XE3 530 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 BRF1Q92994 677 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SMARCA1P28370 1054 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SLC4A3P48751 1232 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 MORN1Q5T089 497 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 MYL10Q9BUA6 226 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 ACAD9Q9H845 621 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 ZNF536O15090 1300 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 MAP2K5Q13163 448 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 FANCBQ8NB91 859 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 MMP19Q99542 508 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 APBA2Q99767 749 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 GJD2Q9UKL4 321 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 GABRQQ9UN88 632 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 NBPF11Q86T75 865 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PXYLP1Q8TE99 480 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 RNF146Q9NTX7 359 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 PLXNB2O15031 1838 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-222ENST00000533362 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ALAS1P13196 640 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ADORA2AP29274 412 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 SNAP25P60880 206 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ANKRD1Q15327 319 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RTN1Q16799 776 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 CPVLQ9H3G5 476 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ZBTB5O15062 677 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ADCY3O60266 1144 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 GRK4P32298 578 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 APOBRQ0VD83 1088 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 DPP9Q86TI2 863 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 USP6NLQ92738 828 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RIPK3Q9Y572 518 aa26.06■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 HOXC6P09630 235 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RXRAP19793 462 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
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PUF60-222ENST00000533362 FBXO11Q86XK2 927 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.05■■□□□ 1.76
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PUF60-222ENST00000533362 AMNQ9BXJ7 453 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 MAF1Q9H063 256 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
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PUF60-222ENST00000533362 ABCB11O95342 1321 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 CYP2B6P20813 491 aa26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 EVCP57679 992 aa26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 MTMR8Q96EF0 704 aa26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 NID2Q14112 1375 aa26.04■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.03■■□□□ 1.76
PUF60-222ENST00000533362 IL27Q8NEV9 243 aa26.03■■□□□ 1.76
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