RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF18P17022 549 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ADCY7P51828 1080 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CCZ1BP86790 482 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 DPF2Q92785 391 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 MKL1Q969V6 931 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 MED15Q96RN5 788 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 NYAP2Q9P242 653 aa25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ENTPD3O75355 529 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TPM2P07951 284 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 ATP2B2Q01814 1243 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CFAP100Q494V2 611 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC93Q567U6 631 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 COA7Q96BR5 231 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 MTRQ99707 1265 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 DISC1Q9NRI5 854 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 FAM196BA6NMK8 535 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 OR52Z1P0C646 297 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC96Q2M329 555 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 LETM2Q2VYF4 491 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TTLL6Q8N841 843 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TBCKQ8TEA7 893 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR8Q96EF0 704 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 STAT6P42226 847 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CUL4BQ13620 913 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.87■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 STAMQ92783 540 aa25.87■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 AK8Q96MA6 479 aa25.87■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SKILP12757 684 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CDC25AP30304 524 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 PSMD1Q99460 953 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM260Q9NX78 707 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 DCAF4Q8WV16 495 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 PP2D1A8MPX8 630 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 UBA7P41226 1012 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 BAG6P46379 1132 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 KCTD1Q719H9 257 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB5O15062 677 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 VSTM4Q8IW00 320 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.84■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.84■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L10C9JJH3 530 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SLC16A2P36021 539 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA1Q5VX52 437 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 INTS13Q9NVM9 706 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 RMND1Q9NWS8 449 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SEPT2Q15019 361 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4D-223ENST00000515011 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 ICA1Q05084 483 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 MYL1P05976 194 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SLFN13Q68D06 897 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CUEDC2Q9H467 287 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 COL4A5P29400 1685 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KCNA3P22001 575 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM232C9JQI7 657 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 DPEP1P16444 411 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms