RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510403.5

SPOCK3-214, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 563 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-214ENST00000510403 TKFCQ3LXA3 575 aa29.42■■■□□ 2.3
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SPOCK3-214ENST00000510403 GABRQQ9UN88 632 aa29.42■■■□□ 2.3
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SPOCK3-214ENST00000510403 ABCB11O95342 1321 aa29.3■■■□□ 2.28
SPOCK3-214ENST00000510403 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29.3■■■□□ 2.28
SPOCK3-214ENST00000510403 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.3■■■□□ 2.28
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