RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DDX11Q96FC9 970 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 KATNBL1Q9H079 304 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXO40Q9UH90 709 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SZT2Q5T011 3432 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MCM3APO60318 1980 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 KBTBD13C9JR72 458 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PGK1P00558 417 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 AKR1A1P14550 325 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ADCYAP1R1P41586 468 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CNTN2Q02246 1040 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 BTNL9Q6UXG8 535 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM133AQ8N9E0 248 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DCAF4Q8WV16 495 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 LRCH3Q96II8 777 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ACAD9Q9H845 621 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TOMM22Q9NS69 142 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF146Q9NTX7 359 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PHF24Q9UPV7 400 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MTMR7Q9Y216 660 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MYADML2A6NDP7 307 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SNHG28P0DPA3 235 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RARBP10826 455 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PDHBP11177 359 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC96Q2M329 555 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC174Q6PII3 467 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FERMT2Q96AC1 680 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 LAMA3Q16787 3333 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC16A2P36021 539 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TRIM60Q495X7 471 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TTC22Q5TAA0 569 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ARMCX2Q7L311 632 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ICAM1P05362 532 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ALAS1P13196 640 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ACVR2BQ13705 512 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TKFCQ3LXA3 575 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PQY0 241 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 POTEB2H3BUK9 544 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 HIP1O00291 1037 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CTAGE5O15320 804 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF543Q08ER8 600 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TDHQ8IZJ6 230 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TTC14Q96N46 770 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-216ENST00000510193 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-216ENST00000510193 NFIBO00712 420 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF213O14771 459 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-216ENST00000510193 KDM4AO75164 1064 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-216ENST00000510193 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-216ENST00000510193 PTGS1P23219 599 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms