RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ACAD9Q9H845 621 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ALAS1P13196 640 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF20Q5VTR2 975 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 SNHG28P0DPA3 235 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF146Q9NTX7 359 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ICAM1P05362 532 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 SNAP25P60880 206 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 TINF2Q9BSI4 451 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF536O15090 1300 aa24.64■■□□□ 1.54
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SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 WTAPQ15007 396 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 DPF3Q92784 378 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 PFASO15067 1338 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 POTEB2H3BUK9 544 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC27A2O14975 620 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 CYBAP13498 195 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 MCM5P33992 734 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC23AQ15436 765 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT4O43236 478 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 NECTIN1Q15223 517 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 CHST3Q7LGC8 479 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHA2P01877 340 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 LHX8Q68G74 356 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 NSMFQ6X4W1 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 TMTC2Q8N394 836 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 MTA3Q9BTC8 594 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 BRCA2P51587 3418 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPV1Q8NER1 839 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM87BQ96K49 555 aa24.58■■□□□ 1.53
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SH3BP2-210ENST00000505941 ASB14A6NK59 587 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 KLRF2D3W0D1 207 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 PRC1O43663 620 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.57■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 REC8O95072 547 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 KRT32Q14532 448 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CPVLQ9H3G5 476 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC69A6NI79 296 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 EVI5O60447 810 aa24.55■■□□□ 1.52
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