RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 CLEC3AO75596 197 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PPM1BO75688 479 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CRTAMO95727 393 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SRGNP10124 158 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RBP3P10745 1247 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CPB1P15086 417 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 VCAM1P19320 739 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 LSSP48449 732 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RING1Q06587 406 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 POU4F3Q15319 338 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RGL3Q3MIN7 710 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 FAM35AQ86V20 835 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GPATCH11Q8N954 259 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 TMEM87BQ96K49 555 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 LRGUKQ96M69 825 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 AAASQ9NRG9 546 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 AKT3Q9Y243 479 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SLC26A4O43511 780 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CTSBP07858 339 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GRIK1P39086 918 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 STK3Q13188 491 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ODF1Q14990 250 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SLC6A19Q695T7 634 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 KIFC2Q96AC6 838 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 C1orf159Q96HA4 380 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 HCSTQ9UBK5 93 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 NAGPAQ9UK23 515 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 IPPQ9Y573 584 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CSADQ9Y600 493 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ASXL2Q76L83 1435 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 H7C1W4 665 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 TNFRSF10AO00220 468 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 AQP7O14520 342 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SHOXO15266 292 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GAS7O60861 476 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CFBP00751 764 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 LIG1P18858 919 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CD247P20963 164 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 MAOBP27338 520 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 GBP1P32455 592 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 ADCY1Q08828 1119 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PDE3AQ14432 1141 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 STYK1Q6J9G0 422 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 TNIP3Q96KP6 325 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SCLT1Q96NL6 688 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.03□□□□□ -1.44
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