RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496910.1

EXOSC3-208, Transcript of exosome component 3, human

TSL 2

Gene EXOSC3, Length 217 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC3-208	ENST00000496910		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	LRRN2	O75325	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MED26	O95402	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	FOSL1	P15407	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PTPRG	P23470	1445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SRF	P11831	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ETV3	P41162	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	RAB33A	Q14088	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	UNC13B	O14795	1591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ABCA8	O94911	1581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910		B2RBV5	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CD97	P48960	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	TNK2	Q07912	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PMM1	Q92871	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MED14	O60244	1454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MEGF6	O75095	1541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CLEC3A	O75596	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	CEACAM5	P06731	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SPINK2	P20155	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	GBP1	P32455	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	GPR162	Q16538	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	DDR2	Q16832	855 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC3-208	ENST00000496910	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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