RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 SLC4A3P48751 1232 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 FGD4Q96M96 766 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 IL25Q9H293 177 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 ASTN1O14525 1302 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP40-217ENST00000496298 PTH1RQ03431 593 aa22.74■■□□□ 1.23
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USP40-217ENST00000496298 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP40-217ENST00000496298 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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