RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLCG1P19174 1290 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SURF1Q15526 300 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 INVSQ9Y283 1065 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.46□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.46□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 DBHP09172 617 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMC7Q7Z402 723 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHFRQ96EP1 664 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPFIA2O75334 1257 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGL3Q3MIN7 710 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQJ5 194 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASGR2P07307 311 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 DSC3Q14574 896 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 ICAM4Q14773 271 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEF6Q9H4E7 631 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD248Q9HCU0 757 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPG7Q9UQ90 795 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP17L7P0C7H9 530 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR5P85299 388 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 JMJD8Q96S16 334 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEP89Q96ST8 783 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf49Q9H741 205 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 MROH6A6NGR9 719 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMTOR5O43504 91 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 GBP1P32455 592 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 MC3RP41968 323 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 SELENOPP49908 381 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMER2Q8N7J2 671 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUSKO15146 869 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIGLEC6O43699 453 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAMEF1O95521 474 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 BICRALQ6AI39 1079 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PALM2Q8IXS6 379 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RETREG2Q8NC44 543 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG3Q92685 438 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 F8W031 263 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF205O95201 554 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 BMP8BP34820 402 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPTQ07507 201 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD18Q0P651 414 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNERQ8NFT8 737 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 TREHO43280 583 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LMO1P25800 156 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIG3P49916 1009 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 JAMLQ86YT9 394 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.36□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 BPNT1O95861 308 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CORO7P57737 925 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOX5Q96PH1 765 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF2CQ99661 725 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHST7Q9NS84 486 aa6.35□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLHL3Q9UH77 587 aa6.35□□□□□ -1.39
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