RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.51■■□□□ 1.67
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USP40-215ENST00000484528 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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USP40-215ENST00000484528 SLC16A2P36021 539 aa25.45■■□□□ 1.66
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USP40-215ENST00000484528 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
USP40-215ENST00000484528 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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USP40-215ENST00000484528 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
USP40-215ENST00000484528 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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