RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482874.1

SLC22A23-208, Transcript of solute carrier family 22 member 23, human

TSL 3

Gene SLC22A23, Length 622 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC22A23-208	ENST00000482874	RNF208	Q9H0X6	261 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SLC22A23-208	ENST00000482874	ICAM1	P05362	532 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	KCTD2	Q14681	263 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	WTAP	Q15007	396 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	TKFC	Q3LXA3	575 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SHISA4	Q96DD7	197 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	FBXO40	Q9UH90	709 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERICH2	A1L162	156 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRC1	O43663	620 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	MCM5	P33992	734 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	GJA8	P48165	433 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAML3	Q96JK9	1138 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	LY9	Q9HBG7	655 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	REC8	O95072	547 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	TROAP	Q12815	778 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCDC174	Q6PII3	467 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMEM87B	Q96K49	555 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	PGK2	P07205	417 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	HSPA4	P34932	840 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CPVL	Q9H3G5	476 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ACAD9	Q9H845	621 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	SGPL1	O95470	568 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	CAPN2	P17655	700 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	LIFR	P42702	1097 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	KRT32	Q14532	448 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	GRM4	Q14833	912 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC22A23-208	ENST00000482874	ALAS1	P13196	640 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CYP2C19	P33261	490 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC4A3	P48751	1232 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	FGD4	Q96M96	766 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAP3K14	Q99558	947 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	PNMA2	Q9UL42	364 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CYBA	P13498	195 aa		27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMTC2	Q8N394	836 aa		27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MTMR8	Q96EF0	704 aa		27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		27.56	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	KLRF2	D3W0D1	207 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	TRPV1	Q8NER1	839 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	DDX11	Q96FC9	970 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	LCT	P09848	1927 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	TINF2	Q9BSI4	451 aa		27.54	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	PFAS	O15067	1338 aa		27.53	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	DDAH1	O94760	285 aa		27.53	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	LHX8	Q68G74	356 aa		27.53	■■■□□ 2
SLC22A23-208	ENST00000482874	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.53	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms