RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 NMT2O60551 498 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 TIMP1P01033 207 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 ASGR1P07306 291 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 ACRP10323 421 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 MS4A1P11836 297 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 RAG1P15918 1043 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 CST5P28325 142 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 GJA9P57773 515 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 NKX3-2P78367 333 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 BEX3Q00994 111 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 TMEM240Q5SV17 173 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 SLFN13Q68D06 897 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 ARMCX2Q7L311 632 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 PDGFCQ9NRA1 345 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 SALL3Q9BXA9 1300 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 DNAJB2P25686 324 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 FPGSQ05932 587 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 DDX11Q96FC9 970 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-206ENST00000474188 MOXD2PA6NHM9 499 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TMEM232C9JQI7 657 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CD4P01730 458 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 FOSL2P15408 326 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CSF2RAP15509 400 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 COPB2P35606 906 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TFAP4Q01664 338 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ADGRE1Q14246 886 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MUM1L1Q5H9M0 696 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 VPS53Q5VIR6 699 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MFSD5Q6N075 450 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 AMOTL1Q8IY63 956 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PBX4Q9BYU1 374 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 HOMER2Q9NSB8 354 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 LCTP09848 1927 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MYH4Q9Y623 1939 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ELP1O95163 1332 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ARVCFO00192 962 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZBED4O75132 1171 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TTLL1O95922 423 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 BMP3P12645 472 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 SMPD1P17405 629 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MCCP23508 829 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CYP2C18P33260 490 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 NOVP48745 357 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TDO2P48775 406 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PPARAQ07869 468 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TAPT1Q6NXT6 567 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 KCTD1Q719H9 257 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CHST13Q8NET6 341 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZNF576Q9H609 170 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 FEM1BQ9UK73 627 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 LRRC37A2A6NM11 1700 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MYO9BQ13459 2157 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 OAZ1P54368 228 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 GNASQ5JWF2 1037 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CXCL17Q6UXB2 119 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZNF365Q70YC5 407 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 RNF146Q9NTX7 359 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 APPP05067 770 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PSMC6P62333 389 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CCDC174Q6PII3 467 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 NUP133Q8WUM0 1156 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 STAG1Q8WVM7 1258 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TIFAQ96CG3 184 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms