RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472446.1

PEMT-208, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, human

TSL 3

Gene PEMT, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEMT-208	ENST00000472446	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	ERC2	O15083	957 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	ASGR1	P07306	291 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	TMEM232	C9JQI7	657 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446		M0R2C6	588 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	STAT2	P52630	851 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	GJA9	P57773	515 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	NAPB	Q9H115	298 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	ACAD9	Q9H845	621 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEMT-208	ENST00000472446	MYADML2	A6NDP7	307 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	FAM160B2	Q86V87	743 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	ARVCF	O00192	962 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	DNAJB2	P25686	324 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TFAP4	Q01664	338 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	SLC1A4	P43007	532 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TKFC	Q3LXA3	575 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446		A0A0C4DFX4	3053 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	ASB14	A6NK59	587 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	CDK7	P50613	346 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	PPARA	Q07869	468 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TIFA	Q96CG3	184 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF576	Q9H609	170 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	ZEB2	O60315	1214 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	FGD4	Q96M96	766 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	STX8	Q9UNK0	236 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PEMT-208	ENST00000472446	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ADCY6	O43306	1168 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	CABYR	O75952	493 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ALAS1	P13196	640 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	CNTN2	Q02246	1040 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	GRIN2C	Q14957	1233 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.57	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	MCC	P23508	829 aa		27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	CSF2RA	P15509	400 aa		27.55	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	BEX3	Q00994	111 aa		27.55	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.55	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	PLA2G6	O60733	806 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	KATNBL1	Q9H079	304 aa		27.54	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	NKX3-2	P78367	333 aa		27.53	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.53	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.53	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	KCTD1	Q719H9	257 aa		27.53	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF536	O15090	1300 aa		27.52	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		27.52	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	ACR	P10323	421 aa		27.52	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PEMT-208	ENST00000472446	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.52	■■■□□ 2

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