RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 ITGB8P26012 769 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CNTN2Q02246 1040 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 VPS53Q5VIR6 699 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 KCTD1Q719H9 257 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 EVI5LQ96CN4 794 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 GMCL1Q96IK5 515 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FGD4Q96M96 766 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 MTMR7Q9Y216 660 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 MYADML2A6NDP7 307 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 SNAP25P60880 206 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ARMCX2Q7L311 632 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ACAD9Q9H845 621 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 SPC25Q9HBM1 224 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 RNF146Q9NTX7 359 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA0355O15063 1070 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ADCY6O43306 1168 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ALAS1P13196 640 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 PDE1AP54750 535 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 FAAP100Q0VG06 881 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC174Q6PII3 467 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 GUCD1Q96NT3 240 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 TOMM22Q9NS69 142 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF536O15090 1300 aa22.8■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SHQ1-206ENST00000471526 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 MYH4Q9Y623 1939 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 PLA2G6O60733 806 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ASGR1P07306 291 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 EPHB4P54760 987 aa22.78■■□□□ 1.24
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SHQ1-206ENST00000471526 TOX2Q96NM4 488 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 LTBP2Q14767 1821 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 COL6A3P12111 3177 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.77■■□□□ 1.24
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SHQ1-206ENST00000471526 ALX1Q15699 326 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC96Q2M329 555 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 KATNBL1Q9H079 304 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-206ENST00000471526 ORC4O43929 436 aa22.76■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 FGAP02671 866 aa22.76■■□□□ 1.23
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SHQ1-206ENST00000471526 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.76■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.76■■□□□ 1.23
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SHQ1-206ENST00000471526 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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SHQ1-206ENST00000471526 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.75■■□□□ 1.23
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SHQ1-206ENST00000471526 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 FGRP09769 529 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 SLC16A2P36021 539 aa22.74■■□□□ 1.23
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SHQ1-206ENST00000471526 BEX3Q00994 111 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 NSMFQ6X4W1 530 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 DCAF4Q8WV16 495 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 LNPKQ9C0E8 428 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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