RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	KCTD2	Q14681	263 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TOX2	Q96NM4	488 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PQY0	241 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	COBL	O75128	1261 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FLOT1	O75955	427 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	IGHA2	P01877	340 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB30	Q15771	203 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP19	Q99542	508 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PGK1	P00558	417 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TIMP1	P01033	207 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CHML	P26374	656 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TTLL1	O95922	423 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	IGFBP4	P22692	258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	DSG3	P32926	999 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	SGSM2	O43147	1006 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGB8	P26012	769 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ACLY	P53396	1101 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	EPHB4	P54760	987 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51	1e-7	■■□□□ 14.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF213	O14771	459 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TFAP4	Q01664	338 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC14	Q96N46	770 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PBX4	Q9BYU1	374 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ELP1	O95163	1332 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245		F5H6K3	240 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PLA2G6	O60733	806 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	PRDM1	O75626	825 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	FDX1	P10109	184 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	KLRC3	Q07444	240 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	ESR2	Q92731	530 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-223	ENST00000466245	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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