RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 RAET1EQ8TD07 263 aa18.53■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 BRF1Q92994 677 aa18.53■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.53■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 MYL10Q9BUA6 226 aa18.53■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.53■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 ICAM1P05362 532 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 SNAP25P60880 206 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 TKFCQ3LXA3 575 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 APOA5Q6Q788 366 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 CPVLQ9H3G5 476 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 FBXO40Q9UH90 709 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.52■□□□□ 0.56
AGRN-204ENST00000466223 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 FCER1AP12319 257 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ALAS1P13196 640 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RXRAP19793 462 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PTPREP23469 700 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 FLT3LGP49771 235 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RCAN1P53805 252 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CAP1Q01518 475 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PRKCZQ05513 592 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 APOBRQ0VD83 1088 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 KCTD2Q14681 263 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PPP2R5BQ15173 497 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ANKRD1Q15327 319 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CHST13Q8NET6 341 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.51■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SMARCA1P28370 1054 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RGS2P41220 211 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 TRAF1Q13077 416 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RTN1Q16799 776 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 IL17RAQ96F46 866 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 MMP19Q99542 508 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 GABRQQ9UN88 632 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.5■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ZNF536O15090 1300 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.554e-7■■□□□ 12
AGRN-204ENST00000466223 DPP9Q86TI2 863 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 DDX11Q96FC9 970 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 BACH2Q9BYV9 841 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ACAD9Q9H845 621 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 GJD2Q9UKL4 321 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RIPK3Q9Y572 518 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.49■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CYP2B6P20813 491 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 NEK4P51957 841 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 MAP2K5Q13163 448 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 IRF5Q13568 498 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 GRB14Q14449 540 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 MORN1Q5T089 497 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 NBPF11Q86T75 865 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 FBXO11Q86XK2 927 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 HOMER1Q86YM7 354 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RIOX1Q9H6W3 641 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 RNF146Q9NTX7 359 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 MYH6P13533 1939 aa18.48■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PLXNB2O15031 1838 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ZBTB5O15062 677 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ADCY3O60266 1144 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ADORA2AP29274 412 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 AMNQ9BXJ7 453 aa18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 EVCP57679 992 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 USH1GQ495M9 461 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PXYLP1Q8TE99 480 aa18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
AGRN-204ENST00000466223 PIGSQ96S52 555 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms