RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PTGDRQ13258 359 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 AOC3Q16853 763 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC17Q96LX7 622 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MTRQ99707 1265 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SDF4Q9BRK5 362 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 VPS33BQ9H267 617 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PARP14Q460N5 1801 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 OFD1O75665 1012 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SLFN14P0C7P3 912 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF18P17022 549 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PBX2P40425 430 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PRPHP41219 470 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 JAG1P78504 1218 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PNOCQ13519 176 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 POSTNQ15063 836 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC15Q8TF66 581 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 EPSTI1Q96J88 318 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CPVLQ9H3G5 476 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NYAP2Q9P242 653 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 STX8Q9UNK0 236 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 F8W031 263 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 MYO1BO43795 1136 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TTLL1O95922 423 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DPEP1P16444 411 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP5P59047 1200 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K10Q02779 954 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DPYDQ12882 1025 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PICALMQ13492 652 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CUL4BQ13620 913 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF174Q15697 407 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC93Q567U6 631 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SPECC1Q5M775 1068 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PIGSQ96S52 555 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KCND1Q9NSA2 647 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 INTS13Q9NVM9 706 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 BIN1O00499 593 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 LAD1O00515 517 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 C21orf2O43822 256 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DOAP06340 250 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 TPM3P06753 285 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PTGS1P23219 599 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MMP14P50281 582 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CACNB3P54284 484 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 MYL5Q02045 173 aa6.43□□□□□ -1.38
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