RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 USP38Q8NB14 1042 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 PMEPA1Q969W9 287 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SEPT3Q9UH03 358 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SOX13Q9UN79 622 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 HHIPQ96QV1 700 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 NARFQ9UHQ1 456 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 AMPHP49418 695 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 MOB2Q70IA6 237 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.71□□□□□ -1.33
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RABGGTB-203ENST00000459697 CDCA5Q96FF9 252 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRDQ9H2X0 955 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-203ENST00000459697 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-203ENST00000459697 COL15A1P39059 1388 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 SMIM22K7EJ46 135 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 NPR1P16066 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 CXCL9Q07325 125 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.342e-7■■■□□ 16.6
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RABGGTB-203ENST00000459697 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-203ENST00000459697 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 THEGQ9P2T0 379 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-203ENST00000459697 MSMPQ1L6U9 139 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 TJP1Q07157 1748 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 EREGO14944 169 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIP5K2O43314 1243 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 PHACTR2O75167 634 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 EDN3P14138 238 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-203ENST00000459697 DRD2P14416 443 aa6.68□□□□□ -1.34
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