RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF543	Q08ER8	600 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	DGKH	Q86XP1	1220 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	PNMA1	Q8ND90	353 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	KAT14	Q9H8E8	782 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	FDX1	P10109	184 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	TINF2	Q9BSI4	451 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627		H0YGN5	161 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNTN2	Q02246	1040 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP4K1	Q92918	833 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	FGD4	Q96M96	766 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	ALPK3	Q96L96	1907 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CHST3	Q7LGC8	479 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627		E7EWF7	191 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	PFAS	O15067	1338 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	NEFL	P07196	543 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEPT4	O43236	478 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ICAM1	P05362	532 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRDN	Q13061	729 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEC23A	Q15436	765 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	CAPN2	P17655	700 aa		28	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	NSMF	Q6X4W1	530 aa		28	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	POTEB2	H3BUK9	544 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	CEP290	O15078	2479 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	EVI5	O60447	810 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	MSC	O60682	206 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	NT5C2	P49902	561 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	NFIB	O00712	420 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL6A1	P12109	1028 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANTXR2	P58335	489 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	NCOA7	Q8NI08	942 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ASTN1	O14525	1302 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC27A2	O14975	620 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	USH1G	Q495M9	461 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		27.95	■■■□□ 2.07
SH3BP5-208	ENST00000459627	LCT	P09848	1927 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	PGK1	P00558	417 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06

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