RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457647.2

RGPD4-AS1-202, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGPD4-AS1, Length 1,792 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SMARCA1P28370 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MAP2K2P36507 400 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SHISA4Q96DD7 197 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PNMA3Q9UL41 463 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MYPNQ86TC9 1320 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CRHR2Q13324 411 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LBX2Q6XYB7 198 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CPXCR1Q8N123 301 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZBTB5O15062 677 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CDKL5O76039 1030 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FOSBP53539 338 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BECN1Q14457 450 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PLS1Q14651 629 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 Q3C1V9 767 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 USH1GQ495M9 461 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 COA7Q96BR5 231 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CPA4Q9UI42 421 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RIPK3Q9Y572 518 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 STK36Q9NRP7 1315 aa14.61□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZBED4O75132 1171 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GJB2P29033 226 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CENPFP49454 3210 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CA12O43570 354 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRPA1O75762 1119 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DEXIO95424 95 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ICAM1P05362 532 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SCG2P13521 617 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ERVK-9P63128 1117 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ERVK-24P63145 666 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RNF186Q9NXI6 227 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.6□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ADAMTS3O15072 1205 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TBC1D8O95759 1140 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BCRP11274 1271 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FBXO11Q86XK2 927 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MB21D1Q8N884 522 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HTTP42858 3142 aa14.58□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 STXBP3O00186 592 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TLR2O60603 784 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 STAT3P40763 770 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 C17orf99Q6UX52 265 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ALG1Q9BT22 464 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AMNQ9BXJ7 453 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PORCNQ9H237 461 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MGAMO43451 1857 aa14.58□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 OPLAHO14841 1288 aa14.57□□□□□ -0.08
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ATP2A1O14983 1001 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms