RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CAPN9O14815 690 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SUN1O94901 812 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PDHBP11177 359 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IFNA8P32881 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB8P50452 374 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RASGRF1Q13972 1273 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KCNB2Q92953 911 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 H0Y3Z8 333 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 STX6O43752 255 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA3DO95025 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KRT13P13646 458 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF6Q15052 776 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 METTL24Q5JXM2 366 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RNF169Q8NCN4 708 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GPATCH3Q96I76 525 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CBX8Q9HC52 389 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PLAAQ9Y263 795 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TLDC2A0PJX2 215 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PRKACAP17612 351 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3CAP42336 1068 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GLMNQ92990 594 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 B3GALT6Q96L58 329 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PARVAQ9NVD7 372 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DACT1Q9NYF0 836 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IFNKQ9P0W0 207 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CBFA2T3O75081 653 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DAB1O75553 588 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KRT2P35908 639 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KANK3Q6NY19 840 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MCM10Q7L590 875 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IFT20Q8IY31 132 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRG0 241 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TAF4O00268 1085 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MUSKO15146 869 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DDB1Q16531 1140 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LPIN2Q92539 896 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RAPGEF5Q92565 580 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR9Q96QG7 549 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 F8W810 466 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 BAIAP3O94812 1187 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PRKACBP22694 351 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCA1P28370 1054 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 AKR1D1P51857 326 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP6P59044 892 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY2DQ02846 1103 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ADALQ6DHV7 355 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FERMT3Q86UX7 667 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf76Q96K31 380 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FSD1Q9BTV5 496 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K5Q99683 1374 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FSBPO95073 299 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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