RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439059.2

AL590683.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AL590683.1, Length 1,849 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL590683.1-201ENST00000439059 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 FBXO11Q86XK2 927 aa14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 AMNQ9BXJ7 453 aa14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.67□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 STXBP3O00186 592 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 ZBED4O75132 1171 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 MMP1P03956 469 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 DSG3P32926 999 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 CCL15Q16663 113 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 CPXCR1Q8N123 301 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 TCHHQ07283 1943 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 SMCO2A6NFE2 343 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 F13A1P00488 732 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 GRM1Q13255 1194 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 ATG4CQ96DT6 458 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.66□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 RLFQ13129 1914 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 VWA5AO00534 786 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 OSBPP22059 807 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 TRAF1Q13077 416 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 RGS22Q8NE09 1264 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 SHISA4Q96DD7 197 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 C6orf50Q9HD87 102 aa14.65□□□□□ -0.06
AL590683.1-201ENST00000439059 BTBD18B2RXH4 712 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 FDX1P10109 184 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 CALML3P27482 149 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 GNA11P29992 359 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 KRT2P35908 639 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MOGSQ13724 837 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 CCDC102AQ96A19 550 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PLS1Q14651 629 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.64□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ICAM1P05362 532 aa14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BLIDQ8IZY5 108 aa14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 OXER1Q8TDS5 423 aa14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.63□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PDHXO00330 501 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 APLP1P51693 650 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 NR5A1Q13285 461 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 GALNT17Q6IS24 598 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BICD2Q8TD16 824 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 PNMA3Q9UL41 463 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MYPNQ86TC9 1320 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 KIF28PB7ZC32 967 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BTBD19C9JJ37 291 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SLC10A3P09131 477 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ALAS1P13196 640 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ADCY7P51828 1080 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 HERVK_113P62684 666 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 RESTQ13127 1097 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 CUL5Q93034 780 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AL590683.1-201ENST00000439059 ZNF536O15090 1300 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms