RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 C14orf37Q86TY3 774 aa7.6□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.6□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.6□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 JMJD8Q96S16 334 aa7.6□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 PARP2Q9UGN5 583 aa7.6□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PQ27 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PQ64 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PQC6 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PQD8 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 SUV39H1O43463 412 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 CTSHP09668 335 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFRSF1AP19438 455 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 PSMD2Q13200 908 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.59□□□□□ -1.19
USP9YP28-201ENST00000435142 CLEC3AO75596 197 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 VAV1P15498 845 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CTSKP43235 329 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ADAM17P78536 824 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 DAB2P98082 770 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 MVKQ03426 396 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 GMIPQ9P107 970 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.58□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PWP1Q13610 501 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CRELD1Q96HD1 420 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.57□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ATF2P15336 505 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 FBLN1P23142 703 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.56□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SH3D21A4FU49 640 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CYBBP04839 570 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CNR2P34972 360 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 HTRA3P83110 453 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.55□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 MATN3O15232 486 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 NOBOXO60393 691 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ATE1O95260 518 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGB3P05106 788 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 DBHP09172 617 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 GARTP22102 1010 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CCNFP41002 786 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SRRDQ9UH36 339 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.54□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PQJ5 194 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SRGAP3O43295 1099 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 FSHBP01225 129 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 RTP2Q5QGT7 225 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 JAMLQ86YT9 394 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ATG4CQ96DT6 458 aa7.53□□□□□ -1.2
USP9YP28-201ENST00000435142 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 NCAM1P13591 858 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNA1Q09470 495 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 BICRALQ6AI39 1079 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 TMC4Q7Z404 712 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 CARFQ8N187 725 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 NAT16Q8N8M0 369 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 LNPKQ9C0E8 428 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 RNF38Q9H0F5 515 aa7.52□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 F8W031 263 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 GSTM1P09488 218 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 PRR5P85299 388 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 CPZQ66K79 652 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM192Q8IY95 271 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM161BQ96MY7 647 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 PRR13Q9NZ81 148 aa7.51□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 GSNP06396 782 aa7.5□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 GJA9P57773 515 aa7.5□□□□□ -1.21
USP9YP28-201ENST00000435142 LRRC3Q9BY71 257 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms