RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SMTNL1A8MU46 457 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SLC1A4P43007 532 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 TBCKQ8TEA7 893 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PP2D1A8MPX8 630 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 GH2P01242 217 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 NIM1KQ8IY84 436 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.34■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1A3P13637 1013 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 CDC25BP30305 580 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY7P51828 1080 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 MORC3Q14149 939 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 E2F4Q16254 413 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SLFN13Q68D06 897 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 VEZTQ9HBM0 779 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 NYAP2Q9P242 653 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ESYT2A0FGR8 921 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 IKBKBO14920 756 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 MYL5Q02045 173 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 MKL1Q969V6 931 aa26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TPM4P67936 248 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 LRMPQ12912 555 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 NEK8Q86SG6 692 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA20Q8TB22 786 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SMC2O95347 1197 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 IQUBQ8NA54 791 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 IFNKQ9P0W0 207 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TPM3P06753 285 aa26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2SQ16763 222 aa26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.86e-7■■■■■ 35.3
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB5O15062 677 aa26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 CXCL9Q07325 125 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 DPYDQ12882 1025 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 F5H6K3 240 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 NEMFO60524 1076 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 KLRC3Q07444 240 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 MTRQ99707 1265 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 FANCLQ9NW38 375 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TXLNAP40222 546 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TGFB2P61812 414 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 PLIN2Q99541 437 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SHTN1A0MZ66 631 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 POLD1P28340 1107 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 ARID5BQ14865 1188 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF4Q8WV16 495 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 CNTNAP1P78357 1384 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TNNI2P48788 182 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SNAP25P60880 206 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 POTEDQ86YR6 584 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 MLKLQ8NB16 471 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 LAD1O00515 517 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFB10O96000 172 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR52Z1P0C646 297 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 STAT6P42226 847 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 FAM151AQ8WW52 585 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 MTMR8Q96EF0 704 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PRG0 241 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 FANCCQ00597 558 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 DISC1Q9NRI5 854 aa26.27■■□□□ 1.8
FAAP20-209ENST00000428120 UBA7P41226 1012 aa26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-209ENST00000428120 CUL4BQ13620 913 aa26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-209ENST00000428120 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-209ENST00000428120 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-209ENST00000428120 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-209ENST00000428120 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms