RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 MTRQ99707 1265 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 ZMYND15Q9H091 742 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 TEX33O43247 280 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 ATP2B4P23634 1241 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 DISC1Q9NRI5 854 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 H7C1D1 291 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 MFAP3LO75121 409 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 IL1R1P14778 569 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 SLF2Q8IX21 1173 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 AK8Q96MA6 479 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.83■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 STXBP3O00186 592 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 RASA1P20936 1047 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TUBB2AQ13885 445 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 MNS1Q8NEH6 495 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 UBXN4Q92575 508 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TADA3O75528 432 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 CASP1P29466 404 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 STAT6P42226 847 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 NOVP48745 357 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 STX17P56962 302 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 DMTNQ08495 405 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 RBL2Q08999 1139 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GNG11P61952 73 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 FANCGO15287 622 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TMTC1Q8IUR5 882 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ADGRG1Q9Y653 693 aa26.8■■□□□ 1.88
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PMS1-205ENST00000409985 CYTH3O43739 400 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 UFL1O94874 794 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KRT31Q15323 416 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 PTPN21Q16825 1174 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KRT222Q8N1A0 295 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KIFC2Q96AC6 838 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.79■■□□□ 1.88
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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PMS1-205ENST00000409985 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 CD209Q9NNX6 404 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.79■■□□□ 1.88
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PMS1-205ENST00000409985 USP17L4A6NCW7 530 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS3O15072 1205 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R2P41236 205 aa26.78■■□□□ 1.88
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PMS1-205ENST00000409985 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ADSSL1Q8N142 457 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GGA1Q9UJY5 639 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ATP8B1O43520 1251 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GNA11P29992 359 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 FAM193AP78312 1265 aa26.77■■□□□ 1.88
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