RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CEP85Q6P2H3 762 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD12-201ENST00000404162 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD12-201ENST00000404162 HIPK3Q9H422 1215 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD12-201ENST00000404162 NCOR1O75376 2440 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD12-201ENST00000404162 ADD2P35612 726 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ARMCX2Q7L311 632 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 KATNBL1Q9H079 304 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CHGBP05060 677 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 NKX3-2P78367 333 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ASTN1O14525 1302 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 F5H6K3 240 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 RFXAPO00287 272 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 KLRC3Q07444 240 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 GRIN2DO15399 1336 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ATP2A1O14983 1001 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 RLBP1P12271 317 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CTR9Q6PD62 1173 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 VWCEQ96DN2 955 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED4O75132 1171 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFB10O96000 172 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 PTGS1P23219 599 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA7Q13683 1181 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 AAK1Q2M2I8 961 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ERC2O15083 957 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CNTN2Q02246 1040 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 TNFAIP2Q03169 654 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 KIFC2Q96AC6 838 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 SCLYQ96I15 445 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD12-201ENST00000404162 ZBBXA8MT70 800 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALT4O60513 344 aa23.14■■□□□ 1.29
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HOXD12-201ENST00000404162 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 BCL11AQ9H165 835 aa23.14■■□□□ 1.29
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HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 NYAP2Q9P242 653 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CHST13Q8NET6 341 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CERS4Q9HA82 394 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO40Q9UH90 709 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CABYRO75952 493 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 RASA1P20936 1047 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC6P62333 389 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TLK2Q86UE8 772 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 KRT40Q6A162 431 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 EPOPA6NHQ4 379 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TLL1O43897 1013 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 CA3P07451 260 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL4Q14679 1199 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 UBE3CQ15386 1083 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TRANK1O15050 2925 aa23.1■■□□□ 1.29
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