RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SMIM23A6NLE4 172 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 PPFIA2O75334 1257 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 KRT15P19012 456 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CNKSR1Q969H4 720 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TXKP42681 527 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DLGAP5Q15398 846 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TNNI1P19237 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 GLG1Q92896 1179 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 MORC3Q14149 939 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TSPYL6Q8N831 410 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC17Q96LX7 622 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DONSONQ9NYP3 566 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 XDHP47989 1333 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CHST3Q7LGC8 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CABP7Q86V35 215 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 BBS5Q8N3I7 341 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CASC4Q6P4E1 433 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SSH3Q8TE77 659 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RLBP1P12271 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SCG2P13521 617 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ATP2B4P23634 1241 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF131P52739 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 GPBP1Q86WP2 473 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CEP120Q8N960 986 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CABS1Q96KC9 395 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DRC3Q9H069 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CEP104O60308 925 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 STX2P32856 288 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 KRT71Q3SY84 523 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 HESX1Q9UBX0 185 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ATP8B1O43520 1251 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TBC1D8O95759 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CD19P15391 556 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RXRAP19793 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 MAGEA1P43355 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 SMCO2A6NFE2 343 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 CBX8Q9HC52 389 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 BRD1O95696 1058 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF853P0CG23 659 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 LIG4P49917 911 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RCAN1P53805 252 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 FANCBQ8NB91 859 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 K7ENM7 598 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 RSPH3Q86UC2 560 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-202ENST00000373184 MFAP3P55082 362 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 SURF1Q15526 300 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 FAM71BQ8TC56 605 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 CEP152O94986 1710 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 BIRC2Q13490 618 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 DBN1Q16643 649 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 NSMFQ6X4W1 530 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 TTC25Q96NG3 672 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 TTC1Q99614 292 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-202ENST00000373184 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms