RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 B4DLN1 442 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 BACH1O14867 736 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TBX22Q9Y458 520 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SIRT1Q96EB6 747 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP7AQ04656 1500 aa20.39■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 COBLO75128 1261 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SARM1Q6SZW1 724 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXO41Q8TF61 875 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PASKQ96RG2 1323 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF5LO75529 589 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SERPINB6P35237 376 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 FANCBQ8NB91 859 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 STK24Q9Y6E0 443 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RFC4P35249 363 aa20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TTC36A6NLP5 189 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 IL2RBP14784 551 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 CXCR5P32302 372 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SP4Q02446 784 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF14Q9UBS8 474 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP2R5DQ14738 602 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 UIMC1Q96RL1 719 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PPFIA2O75334 1257 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP1A3P13637 1013 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RETREG2Q8NC44 543 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF521Q96K83 1311 aa20.37■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SKIP12755 728 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PANX2Q96RD6 677 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ATF2P15336 505 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGDRQ13258 359 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 BLIDQ8IZY5 108 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RDH13Q8NBN7 331 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MAN1A1P33908 653 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCLQ13371 301 aa20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 THEGQ9P2T0 379 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 DBN1Q16643 649 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 EMBQ6PCB8 327 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 LPIN2Q92539 896 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 FGAP02671 866 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 WHAMMQ8TF30 809 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SAAL1Q96ER3 474 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SPATA5Q8NB90 893 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.35■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 NDUFA10O95299 355 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PLTPP55058 493 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ST5P78524 1137 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 BBOF1Q8ND07 529 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TSC22D3Q99576 134 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 HAUS7Q99871 368 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TECP42680 631 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 GIPC1O14908 333 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 LARGE1O95461 756 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 GPBP1Q86WP2 473 aa20.34■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.33■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC7A5Q01650 507 aa20.33■□□□□ 0.85
AMIGO1-202ENST00000369864 SMCO2A6NFE2 343 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms