RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MPP2Q14168 576 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 MEIS1O00470 390 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 ATF2P15336 505 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 FOXO4P98177 505 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 MVKQ03426 396 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 NR1I3Q14994 352 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 SAPCD2Q86UD0 394 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRC-202ENST00000367364 AP5S1Q9NUS5 200 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRC-202ENST00000367364 BMP8BP34820 402 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRC-202ENST00000367364 DBHP09172 617 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 VAV1P15498 845 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-202ENST00000367364 DAB2P98082 770 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 RTP2Q5QGT7 225 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-202ENST00000367364 PARP2Q9UGN5 583 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-202ENST00000367364 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 CYBBP04839 570 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 MC3RP41968 323 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 PSMD2Q13200 908 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 PRR5P85299 388 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC3Q9BY71 257 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 ASGR2P07307 311 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF20P17024 532 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 CCNFP41002 786 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-202ENST00000367364 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PQ64 194 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PQC6 194 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PQD8 194 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRC-202ENST00000367364 BICRALQ6AI39 1079 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 TMC4Q7Z404 712 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 PRR13Q9NZ81 148 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 GSTM1P09488 218 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 NCAM1P13591 858 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 PWP1Q13610 501 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.88□□□□□ -1.15
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