RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 ZNF341Q9BYN7 854 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-204ENST00000361490 TMEM60Q9H2L4 133 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-204ENST00000361490 FANCLQ9NW38 375 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-204ENST00000361490 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-204ENST00000361490 TDP2O95551 362 aa13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NSMFQ6X4W1 530 aa13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.15□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NDUFB10O96000 172 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NLRP12P59046 1061 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FBXO11Q86XK2 927 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MTFR1LQ9H019 292 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FBXO28Q9NVF7 368 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ZNF543Q08ER8 600 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 RESP18Q5W5W9 173 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FERMT2Q96AC1 680 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MAP3K14Q99558 947 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 DACH1Q9UI36 760 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 POTEMA6NI47 508 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SPDYE6P0CI01 402 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ALAS1P13196 640 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 CYP4A11Q02928 519 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ARID5BQ14865 1188 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 KANK3Q6NY19 840 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 CABP7Q86V35 215 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 RAB34Q9BZG1 259 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 STXBP3O00186 592 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 KRT79Q5XKE5 535 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 POTEDQ86YR6 584 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ZNF75DP51815 510 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FLOT1O75955 427 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 EGFRP00533 1210 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 OR52Z1P0C646 297 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYL5Q02045 173 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FUT2Q10981 343 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 DGKZQ13574 1117 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GPR162Q16538 588 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 AP5Z1O43299 807 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 RCAN1P53805 252 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MAEAQ7L5Y9 396 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 WNT10BO00744 389 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ZBTB5O15062 677 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 STIM1Q13586 685 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SPP2Q13103 211 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SHISA4Q96DD7 197 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 TRIM47Q96LD4 638 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 AMNQ9BXJ7 453 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PICK1Q9NRD5 415 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 STAT2P52630 851 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 DLK2Q6UY11 383 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 VPS16Q9H269 839 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 GOPCQ9HD26 462 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 MEIS1O00470 390 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 FANCCQ00597 558 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 SYDE2Q5VT97 1194 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-204ENST00000361490 EXOC1Q9NV70 894 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms