RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 TNNI1P19237 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GLG1Q92896 1179 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MORC3Q14149 939 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TSPYL6Q8N831 410 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC17Q96LX7 622 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DONSONQ9NYP3 566 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 XDHP47989 1333 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CHST3Q7LGC8 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CABP7Q86V35 215 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BBS5Q8N3I7 341 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CASC4Q6P4E1 433 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GPATCH11Q8N954 259 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SSH3Q8TE77 659 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RLBP1P12271 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SCG2P13521 617 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ATP2B4P23634 1241 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF131P52739 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GPBP1Q86WP2 473 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CEP120Q8N960 986 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CABS1Q96KC9 395 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DRC3Q9H069 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZMYND15Q9H091 742 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CEP104O60308 925 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 STX2P32856 288 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KRT71Q3SY84 523 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HESX1Q9UBX0 185 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ATP8B1O43520 1251 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D8O95759 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CD19P15391 556 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RXRAP19793 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA1P43355 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SMCO2A6NFE2 343 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CBX8Q9HC52 389 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BRD1O95696 1058 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF853P0CG23 659 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LIG4P49917 911 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RCAN1P53805 252 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FANCBQ8NB91 859 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 K7ENM7 598 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RSPH3Q86UC2 560 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MFAP3P55082 362 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SURF1Q15526 300 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM71BQ8TC56 605 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CEP152O94986 1710 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 BIRC2Q13490 618 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DBN1Q16643 649 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 NSMFQ6X4W1 530 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TTC25Q96NG3 672 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TTC1Q99614 292 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 RIMBP2O15034 1052 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TTI1O43156 1089 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MGEA5O60502 916 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SP4Q02446 784 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 RRAGAQ7L523 313 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.58□□□□□ -1.36
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