RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLAIN2Q9P270 581 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 RNF40O75150 1001 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 COG1Q8WTW3 980 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM107BQ9H098 131 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CASZ1Q86V15 1759 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 USP17L12C9JPN9 530 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 USP17L21D6R901 530 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PRPHP41219 470 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 FIGNQ5HY92 759 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 A0A1W2PQJ5 194 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NTSR2O95665 410 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 KIF5AQ12840 1032 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SBK1Q52WX2 424 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 WDR59Q6PJI9 974 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 MMS19Q96T76 1030 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 KAT14Q9H8E8 782 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 EFCC1Q9HA90 598 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PPFIA4O75335 1185 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ITIH3Q06033 890 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPA17Q15506 151 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TTI2Q6NXR4 508 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 AK8Q96MA6 479 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TSPY2A6NKD2 308 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ENC1O14682 589 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 KLRC4O43908 158 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PHACTR2O75167 634 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCNE1P24864 410 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 GYG1P46976 350 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRIM58Q8NG06 486 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 EXOC5O00471 708 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CAMTA2O94983 1202 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 IDEP14735 1019 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 MAGEA9P43362 315 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 VAV2P52735 878 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 AMPD3Q01432 767 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 LRRC31Q6UY01 552 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 P2RX5Q93086 422 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 B4DLN1 442 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 TACC1O75410 805 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 DGKHQ86XP1 1220 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-201ENST00000313863 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms