RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.44■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.44■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FLOT1O75955 427 aa27.43■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAPAP54920 295 aa27.43■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE2HP62256 183 aa27.43■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPIL2Q13356 520 aa27.43■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WNK4Q96J92 1243 aa27.43■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FKBP1BP68106 108 aa27.42■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC174Q6PII3 467 aa27.42■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USH1GQ495M9 461 aa27.41■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM205CA6NFA0 338 aa27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.41■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.41■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.4■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELP1O95163 1332 aa27.39■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FSD2A1L4K1 749 aa27.39■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCL11O14625 94 aa27.39■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT2P35908 639 aa27.39■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MOGSQ13724 837 aa27.39■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATG4CQ96DT6 458 aa27.39■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.39■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.38■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMCO2A6NFE2 343 aa27.38■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HUNKP57058 714 aa27.38■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATL3Q6DD88 541 aa27.38■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa27.38■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFAP45Q9UL16 551 aa27.38■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.37■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.37■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMNQ9BXJ7 453 aa27.37■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.37■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YY1P25490 414 aa27.36■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF445P59923 1031 aa27.36■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BLIDQ8IZY5 108 aa27.36■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L18D6R9N7 530 aa27.34■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L19D6RCP7 530 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L20D6RJB6 530 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.34■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEX10O60683 326 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L24Q0WX57 530 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPXCR1Q8N123 301 aa27.34■■□□□ 1.97
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALML3P27482 149 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE2SQ16763 222 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRAPQ7Z569 592 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.34■■□□□ 1.97
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